Является основателем коммуникационного бюро Powerhouse, занявшего первое место среди фирм по связям с общественностью в рейтинге Äripäev TOP 2021. В 1999 году окончил Институт права Тартуского университета по специальности правоведение в 1999 году. В период 1994-1997 гг. работал в Äripäev, с 1997 по 2000 год был вице-президентом SEB Pank и в период 2001-2002 гг. руководил интернет-порталом Евровидения на ЭТВ, а в весенний и осенний сезон 2008 года вел программу по экономике "Миллион центов". С 2005 года Янек является председателем совета Фонда поддержки Таллиннской детской больницы. 5 февраля 2014 г. вместе с Хилле и Тойво Тянавсуу основал ЦУ Фонд борьбы с раком Хилле Тянавсуу "Подаренная жизнь". 9 января 2018 г. вместе с Индреком Лаулом, Вяйно Калдоя и Урмасом Вийлма учредил Церковный фонд (ЦУ Фонд поддержки ЭЕЛК), в котором он является председателем. С 1999 года по январь 2015 г. Янек являлся президентом Эстонского союза шашек. В период 2007-2017 он занимал пост президента Европейской конфедерации шашек (EDC) и с 2017 по 2021 являлся президентом Всемирной федерации шашек (FMJD). С сентября 2015 г. и до конца 2019 г. Янек являлся вице-председателем попечительского совета Эстонской художественной академии. Со 2 мая 2018 г. по 29 апреля 2019 г. Янек входил в состав правительства Эстонской Республики, занимая пост министра государственного управления. Начиная с сентября 2016 он является ведущим мероприятия "Loodud Sõna Õhtu" при церкви Святого Апостола Иоанна в Таллинне. Он издал сборники стихов „Ood rõõmule” (2000) и „Hinge pealt ära” (2009), и он же является автором стихов к альбому „Eesti metsa lugu” (2011). Янек является сценаристом документальных фильмов „Viimsi saared” (2011) и „Viies võim” (2015), соавтором сценариев „Helide maa” (2016) и “Helduse tund” (2018). В 2012 году вышла совместная книга Янека и Юри Аррака „Pind ja palk”. Его статьи публиковались в изданиях Eesti Kirik, Eesti Päevaleht, Delfi, Maaleht, на портале edasi.org, в Postimees, Õhtuleht и Äripäev. В 2021-м году Янек Мягги получил знак отличия III степени от Эстонской Евангелическо-Лютеранской церкви и награду прихода таллиннской церкви Святого Апостола Иоанна.